Species-dependent variation of the gut bacterial communities across Trypanosoma cruzi insect vectors

Los triatominos (Hemiptera: Reduviidae) son los insectos vectores de Trypanosoma cruzi, el agente causal de la enfermedad de Chagas. Las comunidades bacterianas intestinales afectan el desarrollo de T. cruzi dentro del vector, por lo que la caracterización de su composición es importante para compre...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2020
Institución:
Universidad del Rosario
Repositorio:
Repositorio EdocUR - U. Rosario
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repository.urosario.edu.co:10336/34830
Acceso en línea:
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0240916
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Palabra clave:
Actino bacterias
Las bacterias intestinales
Insectos vectores
Insectos
Enfermedades parasitarias
Análisis de componentes principales
Triatoma
Tripanosoma cruzi
Ciencias médicas, Medicina
Enfermedades
Actinobacteria
Gut bacteria
Insect vectors
Insects
Trypanosoma cruzi
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Principal component analysis
Parasitic diseases
Rights
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Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombia
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description Los triatominos (Hemiptera: Reduviidae) son los insectos vectores de Trypanosoma cruzi, el agente causal de la enfermedad de Chagas. Las comunidades bacterianas intestinales afectan el desarrollo de T. cruzi dentro del vector, por lo que la caracterización de su composición es importante para comprender el desarrollo de la infección. Se colectaron 54 chinches triatominos correspondientes a cuatro géneros en diferentes departamentos de Colombia. Se realizó extracción de ADN y PCR para evaluar la presencia de T. cruzi y determinar la unidad de tipificación discreta (DTU) del parásito. Los productos de PCR del gen 16S rRNA bacteriano se agruparon y secuenciaron. Se eliminó el ruido de las lecturas resultantes y se usó QIIME 2 para la identificación de variantes de secuencia de amplicón (ASV). También se realizaron análisis de diversidad (diversidad alfa y beta) y riqueza, diagramas Circos y análisis de componentes principales (PCA). La frecuencia global de infección por T. cruzi fue del 75,9%, siendo TcI la UTD predominante. Se analizaron aproximadamente 500.000 secuencias y se identificaron 27 filos bacterianos. Los filos más abundantes fueron Proteobacteria (33,9 %), Actinobacteria (32,4 %), Firmicutes (19,6 %) y Bacteroidetes (7,6 %), que en conjunto representaron más del 90 % de las comunidades intestinales identificadas en este estudio. Se identificaron géneros para estos filos bacterianos principales, revelando la presencia de bacterias importantes como Rhodococcus, Serratia y Wolbachia. La composición de los filos bacterianos en el intestino de los insectos fue significativamente diferente entre las especies de triatominos, mientras que no se observaron diferencias significativas entre el estado de infección por T. cruzi. Sugerimos una mayor investigación con la evaluación de variables adicionales y un tamaño de muestra más grande. Hasta donde sabemos, este estudio es la primera caracterización de la estructura bacteriana intestinal de los principales géneros de triatominos en Colombia.
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Los productos de PCR del gen 16S rRNA bacteriano se agruparon y secuenciaron. Se eliminó el ruido de las lecturas resultantes y se usó QIIME 2 para la identificación de variantes de secuencia de amplicón (ASV). También se realizaron análisis de diversidad (diversidad alfa y beta) y riqueza, diagramas Circos y análisis de componentes principales (PCA). La frecuencia global de infección por T. cruzi fue del 75,9%, siendo TcI la UTD predominante. Se analizaron aproximadamente 500.000 secuencias y se identificaron 27 filos bacterianos. Los filos más abundantes fueron Proteobacteria (33,9 %), Actinobacteria (32,4 %), Firmicutes (19,6 %) y Bacteroidetes (7,6 %), que en conjunto representaron más del 90 % de las comunidades intestinales identificadas en este estudio. Se identificaron géneros para estos filos bacterianos principales, revelando la presencia de bacterias importantes como Rhodococcus, Serratia y Wolbachia. La composición de los filos bacterianos en el intestino de los insectos fue significativamente diferente entre las especies de triatominos, mientras que no se observaron diferencias significativas entre el estado de infección por T. cruzi. Sugerimos una mayor investigación con la evaluación de variables adicionales y un tamaño de muestra más grande. Hasta donde sabemos, este estudio es la primera caracterización de la estructura bacteriana intestinal de los principales géneros de triatominos en Colombia.Triatomines (Hemiptera: Reduviidae) are the insect vectors of Trypanosoma cruzi, the causative agent of Chagas disease. The gut bacterial communities affect the development of T. cruzi inside the vector, making the characterization of its composition important in the understanding of infection development. We collected 54 triatomine bugs corresponding to four genera in different departments of Colombia. DNA extraction and PCR were performed to evaluate T. cruzi presence and to determine the discrete typing unit (DTU) of the parasite. PCR products of the bacterial 16S rRNA gene were pooled and sequenced. Resulting reads were denoised and QIIME 2 was used for the identification of amplicon sequence variants (ASVs). Diversity (alpha and beta diversity) and richness analyses, Circos plots, and principal component analysis (PCA) were also performed. The overall T. cruzi infection frequency was 75.9%, with TcI being the predominant DTU. Approximately 500,000 sequences were analyzed and 27 bacterial phyla were identified. The most abundant phyla were Proteobacteria (33.9%), Actinobacteria (32.4%), Firmicutes (19.6%), and Bacteroidetes (7.6%), which together accounted for over 90% of the gut communities identified in this study. Genera were identified for these main bacterial phyla, revealing the presence of important bacteria such as Rhodococcus, Serratia, and Wolbachia. The composition of bacterial phyla in the gut of the insects was significantly different between triatomine species, whereas no significant difference was seen between the state of T. cruzi infection. We suggest further investigation with the evaluation of additional variables and a larger sample size. To our knowledge, this study is the first characterization of the gut bacterial structure of the main triatomine genera in Colombia.16 ppapplication/pdfhttps://doi.org/10.1371/journal.pone.02409161932-6203https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/34830enghttps://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0240916Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 ColombiaAbierto (Texto Completo)EL AUTOR, manifiesta que la obra objeto de la presente autorización es original y la realizó sin violar o usurpar derechos de autor de terceros, por lo tanto la obra es de exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre la misma. PARGRAFO: En caso de presentarse cualquier reclamación o acción por parte de un tercero en cuanto a los derechos de autor sobre la obra en cuestión, EL AUTOR, asumirá toda la responsabilidad, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos la universidad actúa como un tercero de buena fe. EL AUTOR, autoriza a LA UNIVERSIDAD DEL ROSARIO, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, Ley 44 de 1993, Decisión andina 351 de 1993, Decreto 460 de 1995 y demás normas generales sobre la materia, utilice y use la obra objeto de la presente autorización. -------------------------------------- POLITICA DE TRATAMIENTO DE DATOS PERSONALES. Declaro que autorizo previa y de forma informada el tratamiento de mis datos personales por parte de LA UNIVERSIDAD DEL ROSARIO para fines académicos y en aplicación de convenios con terceros o servicios conexos con actividades propias de la academia, con estricto cumplimiento de los principios de ley. Para el correcto ejercicio de mi derecho de habeas data cuento con la cuenta de correo habeasdata@urosario.edu.co, donde previa identificación podré solicitar la consulta, corrección y supresión de mis datos.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2instname:Universidad del Rosarioreponame:Repositorio Institucional EdocURActino bacteriasLas bacterias intestinalesInsectos vectoresInsectosEnfermedades parasitariasAnálisis de componentes principalesTriatomaTripanosoma cruziCiencias médicas, Medicina610600Enfermedades616600ActinobacteriaGut bacteriaInsect vectorsInsectsTrypanosoma cruziTriatomaPrincipal component analysisParasitic diseasesSpecies-dependent variation of the gut bacterial communities across Trypanosoma cruzi insect vectorsarticleArtículohttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85http://purl.org/coar/resource_type/c_6501Arias-Giraldo, Luisa M.Muñoz, MarinaHernández, CarolinaHerrera, GiovannyVelásquez-Ortiz, NataliaCantillo Barraza, OmarUrbano, PlutarcoRamírez, Juan DavidCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81037https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/a8cd4ac7-b0ff-4cb7-94a3-f0893b84d9b2/download1487462a1490a8fc01f5999ce7b3b9ccMD53ORIGINALSpecies-dependent variation.pdfSpecies-dependent variation.pdfapplication/pdf1554842https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/9ec1d6ed-4f7a-433c-9782-dfe29334b476/download12fbe7aaded02a556f1ca7f19e445c55MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1475https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/24e78fb7-7366-496b-8f6e-d5531ad2a05a/downloadfab9d9ed61d64f6ac005dee3306ae77eMD52TEXTSpecies-dependent variation.pdf.txtSpecies-dependent variation.pdf.txtExtracted texttext/plain55585https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/247f130f-813c-484a-90a2-e1093ba6bfec/download4b0a04a5127e683545bebbd8553d8669MD54THUMBNAILSpecies-dependent variation.pdf.jpgSpecies-dependent variation.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4459https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/d4e659df-cee2-4269-9762-5481d8163646/download60fa607c49172d8597ec54ceec4cbaadMD5510336/34830oai:repository.urosario.edu.co:10336/348302022-09-01 03:03:56.401http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombiahttps://repository.urosario.edu.coRepositorio institucional EdocURedocur@urosario.edu.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