Gut microbiota profiles in diarrheic patients with co-occurrence of Clostridioides difficile and Blastocystis
La co-ocurrencia de Blastocystis y Clostridioides difficile se considera un evento raro ya que la colonización por Blastocystis se previene bajo una disminución de bacterias beneficiosas en la microbiota cuando hay infección por C. difficile (ICD). Este escenario se informó una vez, pero no hay info...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad del Rosario
- Repositorio:
- Repositorio EdocUR - U. Rosario
- Idioma:
- eng
- OAI Identifier:
- oai:repository.urosario.edu.co:10336/34831
- Acceso en línea:
- https://doi.org/10.1371/journal.pone.0248185
https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/34831
- Palabra clave:
- Bacterias
Biomarcadores
Blastocistis
Eucariota
Hongos
Tracto gastrointestinal
Bacterias intestinales
Protistas
Enfermedades
Biomarkers
Blastocystis
Eukaryota
Fungi
Gastrointestinal tract
Gut bacteria
Protists
- Rights
- License
- Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombia
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La co-ocurrencia de Blastocystis y Clostridioides difficile se considera un evento raro ya que la colonización por Blastocystis se previene bajo una disminución de bacterias beneficiosas en la microbiota cuando hay infección por C. difficile (ICD). Este escenario se informó una vez, pero no hay información disponible sobre el perfil de la microbiota intestinal. El presente estudio está motivado por saber qué miembros de la microbiota se pueden encontrar en este raro escenario y cómo esta co-ocurrencia puede afectar la abundancia de otras bacterias, eucariotas o arqueas presentes en la microbiota intestinal. Este estudio tuvo como objetivo describir las comunidades bacterianas y eucarióticas utilizando la secuenciación basada en amplicones de las regiones 16S- y 18S-rRNA de tres grupos de pacientes: (1) Blastocystis y infección por C. difficile (B+/C+, n = 31), (2 ) Solo infección por C. difficile (B−/C+, n = 44), y (3) sin Blastocystis o C. difficile (B−/C−, n = 40). Blastocystis se subtipificó mediante secuenciación basada en amplicón del gen 18S-rRNA, lo que reveló la circulación de los subtipos ST1 (43,4 %), ST3 (35,85 %) y ST5 (20,75 %) entre la población del estudio. Descubrimos que los pacientes B+/C+ tenían una mayor abundancia de algunas bacterias beneficiosas (como las productoras de butirato o bacterias con propiedades antiinflamatorias) en comparación con los pacientes no colonizados con Blasto cystis, lo que puede sugerir un cambio hacia un aumento de bacterias beneficiosas. ria cuando Blastocystis coloniza a pacientes con CDI. En cuanto a las comunidades eucariotas, no se observaron diferencias estadísticas en la abundancia de algunos géneros eucariotas entre los grupos de estudio. Por lo tanto, este estudio proporciona información descriptiva preliminar de un perfil de microbiota potencial de presencia diferencial por Blastocystis y C. difficile. |
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Este estudio tuvo como objetivo describir las comunidades bacterianas y eucarióticas utilizando la secuenciación basada en amplicones de las regiones 16S- y 18S-rRNA de tres grupos de pacientes: (1) Blastocystis y infección por C. difficile (B+/C+, n = 31), (2 ) Solo infección por C. difficile (B−/C+, n = 44), y (3) sin Blastocystis o C. difficile (B−/C−, n = 40). Blastocystis se subtipificó mediante secuenciación basada en amplicón del gen 18S-rRNA, lo que reveló la circulación de los subtipos ST1 (43,4 %), ST3 (35,85 %) y ST5 (20,75 %) entre la población del estudio. Descubrimos que los pacientes B+/C+ tenían una mayor abundancia de algunas bacterias beneficiosas (como las productoras de butirato o bacterias con propiedades antiinflamatorias) en comparación con los pacientes no colonizados con Blasto cystis, lo que puede sugerir un cambio hacia un aumento de bacterias beneficiosas. ria cuando Blastocystis coloniza a pacientes con CDI. En cuanto a las comunidades eucariotas, no se observaron diferencias estadísticas en la abundancia de algunos géneros eucariotas entre los grupos de estudio. Por lo tanto, este estudio proporciona información descriptiva preliminar de un perfil de microbiota potencial de presencia diferencial por Blastocystis y C. difficile.Blastocystis and Clostridioides difficile co-occurrence is considered a rare event since the colonization by Blastocystis is prevented under a decrease in beneficial bacteria in the microbiota when there is C. difficile infection (CDI). This scenario has been reported once, but no information on the gut microbiota profiling is available. The present study is motivated by knowing which members of the microbiota can be found in this rare scenario and how this co-occurrence may impact the abundance of other bacteria, eukaryotes or archaea present in the gut microbiota. This study aimed to describe the bacterial and eukaryotic communities using amplicon-based sequencing of the 16S- and 18S-rRNA regions of three patient groups: (1) Blastocystis and C. difficile infection (B+/C+, n = 31), (2) C. difficile infection only (B−/C+, n = 44), and (3) without Blastocystis or C. difficile (B−/C−, n = 40). Blastocystis was subtyped using amplicon-based sequencing of the 18S-rRNA gene, revealing circulation of subtypes ST1 (43.4%), ST3 (35.85%) and ST5 (20.75%) among the study population. We found that B+/C+ patients had a higher abundance of some beneficial bacteria (such as butyrate producers or bacteria with anti-inflammatory properties) compared with non-Blasto cystis-colonized patients, which may suggest a shift towards an increase in beneficial bacte ria when Blastocystis colonizes patients with CDI. Regarding eukaryotic communities, statistical differences in the abundance of some eukaryotic genera between the study groups were not observed. Thus, this study provides preliminary descriptive information of a potential microbiota profiling of differential presence by Blastocystis and C. difficile.23 ppapplication/pdfhttps://doi.org/10.1371/journal.pone.02481851932-6203https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/34831enghttps://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0248185Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 ColombiaAbierto (Texto Completo)EL AUTOR, manifiesta que la obra objeto de la presente autorización es original y la realizó sin violar o usurpar derechos de autor de terceros, por lo tanto la obra es de exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre la misma. PARGRAFO: En caso de presentarse cualquier reclamación o acción por parte de un tercero en cuanto a los derechos de autor sobre la obra en cuestión, EL AUTOR, asumirá toda la responsabilidad, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos la universidad actúa como un tercero de buena fe. EL AUTOR, autoriza a LA UNIVERSIDAD DEL ROSARIO, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, Ley 44 de 1993, Decisión andina 351 de 1993, Decreto 460 de 1995 y demás normas generales sobre la materia, utilice y use la obra objeto de la presente autorización. -------------------------------------- POLITICA DE TRATAMIENTO DE DATOS PERSONALES. Declaro que autorizo previa y de forma informada el tratamiento de mis datos personales por parte de LA UNIVERSIDAD DEL ROSARIO para fines académicos y en aplicación de convenios con terceros o servicios conexos con actividades propias de la academia, con estricto cumplimiento de los principios de ley. Para el correcto ejercicio de mi derecho de habeas data cuento con la cuenta de correo habeasdata@urosario.edu.co, donde previa identificación podré solicitar la consulta, corrección y supresión de mis datos.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2instname:Universidad del Rosarioreponame:Repositorio Institucional EdocURBacteriasBiomarcadoresBlastocistisEucariotaHongosTracto gastrointestinalBacterias intestinalesProtistasEnfermedades616600BiomarkersBlastocystisEukaryotaFungiGastrointestinal tractGut bacteriaProtistsGut microbiota profiles in diarrheic patients with co-occurrence of Clostridioides difficile and BlastocystisarticleArtículohttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85http://purl.org/coar/resource_type/c_6501Vega, LauraHerrera, GiovannyMuñoz, MarinaPatarroyo, Manuel A.Maloney, Jenny G.Santín, MonicaRamírez, Juan DavidORIGINALGut microbiota profiles in diarrheic.pdfGut microbiota profiles in diarrheic.pdfapplication/pdf2387886https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/d2c783cb-f9b6-45b4-9f37-403bcf5897a3/download04ac6b44eff4d2e3154450ac53e88b8cMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1475https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/e05f7af4-c8ad-472f-9ecc-500dfa33d3fb/downloadfab9d9ed61d64f6ac005dee3306ae77eMD52CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81037https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/40d790fc-615d-4134-9594-859a1e14e972/download1487462a1490a8fc01f5999ce7b3b9ccMD53TEXTGut microbiota profiles in diarrheic.pdf.txtGut microbiota profiles in diarrheic.pdf.txtExtracted texttext/plain85333https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/beac73f2-c921-4ce0-a4a1-dcd6183fde6d/downloada0f96b047d6df582cd306a139273d2a9MD54THUMBNAILGut microbiota profiles in diarrheic.pdf.jpgGut microbiota profiles in diarrheic.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4480https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/929ad947-b8fc-4f06-bd39-201ea959711a/download5d06d176fbbc7b897f05a7e5327f6938MD5510336/34831oai:repository.urosario.edu.co:10336/348312022-09-01 03:04:06.701http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombiahttps://repository.urosario.edu.coRepositorio institucional EdocURedocur@urosario.edu.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 |