The dynamics of local hiv-1 epidemics: the colombian and belgian cohorts

We aimed to characterize the HIV-1 epidemic of the Belgian and Colombian cohorts using an integrated approach that includes socio-demographic information, clinical data, and viral sequences, analyzed with statistical and phylogenetic approaches.

Autores:
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2014
Institución:
Universidad del Rosario
Repositorio:
Repositorio EdocUR - U. Rosario
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.urosario.edu.co:10336/9018
Acceso en línea:
https://doi.org/10.48713/10336_9018
http://repository.urosario.edu.co/handle/10336/9018
Palabra clave:
resistance
HIV
epidemiology
subtypes
prevention
phylogenetics
phylodynamics
Belgium
Colombia
TasP
Incidencia & prevención de la enfermedad
Síndrome de Inmunodeficiencia Adquirida. SIDA
Epidemiología
Filogenética
Medicina
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spelling Vandamme, Anne-Miekee3baf816-9033-441f-acc5-8486f63b7597-1Gómez López, Arley45746808-3cd9-4406-9bdb-f447c2188ab6600Van Laethem, Kristelf0781032-c093-429a-b4dc-e73aa8622595-1Sussmann, Otto59ecd460-b6ed-4aac-8906-978b54a71ec0-1Pineda-Peña, Andrea-ClemenciaDoctor en Ciencias Biomédicas571f4f41-be80-49fc-9edf-99172e5d1072-12014-11-14T13:59:45Z2014-11-14T13:59:45Z2014-08-272014We aimed to characterize the HIV-1 epidemic of the Belgian and Colombian cohorts using an integrated approach that includes socio-demographic information, clinical data, and viral sequences, analyzed with statistical and phylogenetic approaches.Andrea-Clemencia Pineda-Peña was supported by a Doctoral Research Training Program ‘‘Francisco Jose de Caldas’’ by the Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, COLCIENCIAS, Republic of Colombia and ERACOL academic exchange in medicine and the health sciences, between Europe and Latin America. The research was supported in part by the European Community’s Seventh Framework Programme (FP7/2007–2013) under the project ‘‘Collaborative HIV and Anti-HIV Drug Resistance Network (CHAIN)’’ grant agreement n° 223131 and ERC grant agreement no. 260864; by the Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek – Flanders (FWO) grant G.0611.09 and grant G069214N; by the AIDS Reference Laboratory of Leuven that receives support from the Belgian Ministry of Social Affairs through a fund within the Health Insurance System; by the University of Leuven (Program Financing no. PF/10/018. The computational resources and services used in this work were provided by the Hercules Foundation and the Flemish Government – department EWI-FWO Krediet aan Navorsers (Theys, KAN2012 1.5.249.12). The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscripts.application/pdfhttps://doi.org/10.48713/10336_9018 http://repository.urosario.edu.co/handle/10336/9018spaUniversidad del RosarioFacultad de Ciencias Naturales y MatemáticasDoctorado en Ciencias BiomédicasAbierto (Texto completo)Atribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 ColombiaEL AUTOR, manifiesta que la obra objeto de la presente autorización es original y la realizó sin violar o usurpar derechos de autor de terceros, por lo tanto la obra es de exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre la misma. PARGRAFO: En caso de presentarse cualquier reclamación o acción por parte de un tercero en cuanto a los derechos de autor sobre la obra en cuestión, EL AUTOR, asumirá toda la responsabilidad, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos la universidad actúa como un tercero de buena fe. EL AUTOR, autoriza a LA UNIVERSIDAD DEL ROSARIO, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, Ley 44 de 1993, Decisión andina 351 de 1993, Decreto 460 de 1995 y demás normas generales sobre la materia, utilice y use la obra objeto de la presente autorización. -------------------------------------- POLITICA DE TRATAMIENTO DE DATOS PERSONALES. Declaro que autorizo previa y de forma informada el tratamiento de mis datos personales por parte de LA UNIVERSIDAD DEL ROSARIO para fines académicos y en aplicación de convenios con terceros o servicios conexos con actividades propias de la academia, con estricto cumplimiento de los principios de ley. Para el correcto ejercicio de mi derecho de habeas data cuento con la cuenta de correo habeasdata@urosario.edu.co, donde previa identificación podré solicitar la consulta, corrección y supresión de mis datos.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Pineda-Peña AC, Schrooten Y, Vinken L, Ferreira F, Li G, Sequeira Trovão N, Khouri R, Derdelinckx I, De Munter P, Kücherer C, Kostrikis LG, Nielsen C, Littsola K, Wensing A, Stanojevic M, Paredes R, Balotta C, Albert J, Boucher C, Gomez-Lopez A, Van Wijngaerden E, Van Ranst M, Vercauteren J, Vandamme AM, Van Laethem K. Trends and predictors of transmitted drug resistance (TDR) and clusters with TDR in a local Belgian HIV-1 epidemic. Plos One. 2014; 9(7): e101738instname:Universidad del Rosarioreponame:Repositorio Institucional EdocURresistanceHIVepidemiologysubtypespreventionphylogeneticsphylodynamicsBelgiumColombiaTasPIncidencia & prevención de la enfermedad614600Síndrome de Inmunodeficiencia Adquirida. SIDAEpidemiologíaFilogenéticaMedicinaepidemiologyHIV-1subtypesresistancepreventionPhylogeneticsPhylodynamicsTasPBelgiumColombiaThe dynamics of local hiv-1 epidemics: the colombian and belgian cohortsdoctoralThesisTesis de doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06Escuela de Medicina y Ciencias de la SaludORIGINALPineda-Pena-Andrea-Clemencia-2014.pdfPineda-Pena-Andrea-Clemencia-2014.pdfapplication/pdf13487448https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/2c4035f3-b243-49ee-97de-f98dd723a08e/downloade151604a2b825097391f9b4e80fcdb7fMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain2185https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/759e0caa-fa8f-4a62-a5f2-ac4d8647cf98/downloadeec927db589d344458fd08e8d91ecd45MD52CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/octet-stream1232https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/d84079ce-f7c3-4e56-86fc-524741805b33/downloadf9ed9991c69a90105c85883242745140MD53TEXTPineda-Pena-Andrea-Clemencia-2014.pdf.txtPineda-Pena-Andrea-Clemencia-2014.pdf.txtExtracted Texttext/plain673356https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/50aafad4-42b2-4bfb-a04f-32a06afea19f/downloadb491a380177d306941f09f4e86f695bdMD54THUMBNAILPineda-Pena-Andrea-Clemencia-2014.pdf.jpgPineda-Pena-Andrea-Clemencia-2014.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1632https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/b0677a9e-92a0-42f5-bffa-116fa8bf6b26/download8d38f69404db8589db25deb3cf879d76MD5510336/9018oai:repository.urosario.edu.co:10336/90182021-06-03 00:45:50.341http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/https://repository.urosario.edu.coRepositorio institucional EdocURedocur@urosario.edu.coQWN0dWFuZG8gZW4gbm9tYnJlIHByb3BpbywgZW4gY2FsaWRhZCBkZSBhdXRvciBkZWwgdHJhYmFqbyBkZSB0ZXNpcywgbW9ub2dyYWbDrWEgbyB0cmFiYWpvIGRlIGdyYWRvLgoKSGFnbyhIYWNlbW9zKSBlbnRyZWdhIGRlbCBlamVtcGxhciByZXNwZWN0aXZvIHkgZGUgc3VzIGFuZXhvcyBlbiBmb3JtYXRvIGRpZ2l0YWwgbyBlbGVjdHLDs25pY28geSBhdXRvcml6byAKYSBMQSBVTklWRVJTSURBRCBERUwgUk9TQVJJTywgcGFyYSBxdWUgZW4gbG9zIHTDqXJtaW5vcyBlc3RhYmxlY2lkb3MgZW4gbGEgTGV5IDIzIGRlIDE5ODIsICBMZXkgNDQgZGUgMTk5MywKRGVjaXNpw7NuIGFuZGluYSAzNTEgZGUgMTk5MywgRGVjcmV0byA0NjAgZGUgMTk5NSB5IGRlbcOhcyBub3JtYXMgZ2VuZXJhbGVzIHNvYnJlIGxhIG1hdGVyaWEsIHV0aWxpY2UgeSB1c2UKcG9yIGN1YWxxdWllciAgbWVkaW8gIGNvbm9jaWRvIG8gcG9yIGNvbm9jZXIsIGxvcyBkZXJlY2hvcyBwYXRyaW1vbmlhbGVzIGRlIHJlcHJvZHVjY2nDs24sIGNvbXVuaWNhY2nDs24gcMO6LQpibGljYSx0cmFuc2Zvcm1hY2nDs24geSBkaXN0cmlidWNpw7NuIHF1ZSBtZSBjb3JyZXNwb25kZW4gY29tbyBjcmVhZG9yKGNyZWFkb3JlcykgZGUgbGEgb2JyYSBvYmpldG8gZGVsIHByZS0Kc2VudGUgZG9jdW1lbnRvLiAKClBBUkFHUkFGTzogTGEgcHJlc2VudGUgYXV0b3JpemFjacOzbiBzZSBoYWNlIGV4dGVuc2l2YSBubyBzw7NsbyBhIGxhcyBmYWN1bHRhZGVzIHkgZGVyZWNob3MgZGUgdXNvIHNvYnJlIGxhCm9icmEgZW4gZm9ybWF0byBvIHNvcG9ydGUgbWF0ZXJpYWwsIHNpbm8gdGFtYmnDqW4gcGFyYSBmb3JtYXRvIHZpcnR1YWwsIGVsZWN0csOzbmljbywgZGlnaXRhbCwgw7NwdGljbywgdXNvcwplbiByZWQsIGludGVybmV0LCBleHRyYW5ldCwgaW50cmFuZXQsIGV0Yy4sIHkgZW4gZ2VuZXJhbCBlbiBjdWFscXVpZXIgZm9ybWF0byBjb25vY2lkbyBvIHBvciBjb25vY2VyLgoKRUwoTE9TKSBFU1RVRElBTlRFKFMpIC0gQVVUT1IoRVMpLCBtYW5pZmllc3RhKG1hbmlmZXN0YW1vcykgcXVlIGxhIG9icmEgb2JqZXRvIGRlIGxhIHByZXNlbnRlIGF1dG9yaXphY2nDs24KZXMgb3JpZ2luYWwgeSBsYSByZWFsaXphbW9zIHNpbiB2aW9sYXIgbyB1c3VycGFyIGRlcmVjaG9zIGRlIGF1dG9yIGRlIHRlcmNlcm9zLCBwb3IgbG8gdGFudG8gbGEgb2JyYSBlcyBkZQpleGNsdXNpdmEgYXV0b3LDrWEgeSB0aWVuZSBsYSB0aXR1bGFyaWRhZCBzb2JyZSBsYSBtaXNtYS4gCgpQQVJBR1JBRk86ICBFbiBjYXNvIGRlIHByZXNlbnRhcnNlIGN1YWxxdWllciByZWNsYW1hY2nDs24gbyBhY2Npw7NuIHBvciBwYXJ0ZSBkZSB1biB0ZXJjZXJvIGVuIGN1YW50byBhIGxvcyAKZGVyZWNob3MgZGUgYXV0b3Igc29icmUgbGEgb2JyYSBlbiBjdWVzdGnDs24sIEVMIEVTVFVESUFOVEUgLSBBVVRPUiwgYXN1bWlyZW1vcyB0b2RhIGxhIHJlc3BvbnNhYmlsaWRhZCwgeQpzYWxkcsOhIGVuICBkZWZlbnNhICBkZSBsb3MgZGVyZWNob3MgYXF1w60gYXV0b3JpemFkb3M7IHBhcmEgdG9kb3MgbG9zIGVmZWN0b3MgbGEgdW5pdmVyc2lkYWQgYWN0w7phIGNvbW8gdW4gCnRlcmNlcm8gZGUgYnVlbmEgZmUuICAKCgpQT0xJVElDQSBERSBUUkFUQU1JRU5UTyBERSBEQVRPUyBQRVJTT05BTEVTLiBEZWNsYXJvIHF1ZSBhdXRvcml6byBwcmV2aWEgeSBkZSBmb3JtYSBpbmZvcm1hZGEgZWwgdHJhdGFtaWVudG8KZGUgbWlzIGRhdG9zIHBlcnNvbmFsZXMgcG9yICBwYXJ0ZSAgZGUgIExBIFVOSVZFUlNJREFEIERFTCBST1NBUklPICBwYXJhIGZpbmVzIGFjYWTDqW1pY29zIHkgZW4gYXBsaWNhY2nDs24gZGUKY29udmVuaW9zIGNvbiB0ZXJjZXJvcyBvIHNlcnZpY2lvcyBjb25leG9zIGNvbiBhY3RpdmlkYWRlcyBwcm9waWFzIGRlIGxhIGFjYWRlbWlhLCBjb24gZXN0cmljdG8gY3VtcGxpbWllbnRvCmRlIGxvcyBwcmluY2lwaW9zIGRlIGxleS4gUGFyYSBlbCBjb3JyZWN0byBlamVyY2ljaW8gZGUgbWkgZGVyZWNobyBkZSBoYWJlYXMgZGF0YSwgY3VlbnRvICBjb24gIGxhIGN1ZW50YSBkZQpjb3JyZW8gaGFiZWFzZGF0YUB1cm9zYXJpby5lZHUuY28sIGRvbmRlIHByZXZpYSBpZGVudGlmaWNhY2nDs24gcG9kcsOhICBzb2xpY2l0YXIgIGxhICBjb25zdWx0YSwgIGNvcnJlY2Npw7NuIHkKc3VwcmVzacOzbiBkZSBtaXMgZGF0b3MuCg==