Germline mutations of breast cancer susceptibility genes through expanded genetic analysis in unselected Colombian patients

En Colombia y el mundo, el cáncer de mama (CM) es la neoplasia más frecuentemente diagnosticada y la principal causa de muerte por cáncer entre las mujeres. Los estudios involucran predominantemente casos hereditarios y familiares, lo que demuestra una brecha en la literatura con respecto a la ident...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2024
Institución:
Universidad del Rosario
Repositorio:
Repositorio EdocUR - U. Rosario
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repository.urosario.edu.co:10336/42905
Acceso en línea:
https://doi.org/10.1186/s40246-024-00623-7
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Palabra clave:
Unselected breast cancer
Whole exome sequencing
Pathogenic germline variants
Minigene assay
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Rights
License
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description En Colombia y el mundo, el cáncer de mama (CM) es la neoplasia más frecuentemente diagnosticada y la principal causa de muerte por cáncer entre las mujeres. Los estudios involucran predominantemente casos hereditarios y familiares, lo que demuestra una brecha en la literatura con respecto a la identificación de mutaciones de la línea germinal en pacientes no seleccionados de América Latina. La identificación de variantes patógenas/probablemente patógenas (P/LP) es importante para dar forma a las políticas nacionales de análisis genético, el asesoramiento genético y las estrategias de detección temprana. El presente estudio incluyó a 400 mujeres con cáncer de mama (CM) no seleccionado, en quienes analizamos diez genes, utilizando la secuenciación del exoma completo (WES), que confieren riesgo de CM, con el objetivo de determinar el perfil genómico de P/LP no informado previamente. variantes en la población afectada. Además, se realizó una amplificación de sonda dependiente de ligadura múltiple (MLPA) para identificar grandes reordenamientos genómicos (LGR) en los genes BRCA1/2. Para determinar el impacto funcional de una variante intrónica recurrente (ATM c.5496?+?2_5496?+?5delTAAG), se realizó un ensayo de minigén.
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Los estudios involucran predominantemente casos hereditarios y familiares, lo que demuestra una brecha en la literatura con respecto a la identificación de mutaciones de la línea germinal en pacientes no seleccionados de América Latina. La identificación de variantes patógenas/probablemente patógenas (P/LP) es importante para dar forma a las políticas nacionales de análisis genético, el asesoramiento genético y las estrategias de detección temprana. El presente estudio incluyó a 400 mujeres con cáncer de mama (CM) no seleccionado, en quienes analizamos diez genes, utilizando la secuenciación del exoma completo (WES), que confieren riesgo de CM, con el objetivo de determinar el perfil genómico de P/LP no informado previamente. variantes en la población afectada. Además, se realizó una amplificación de sonda dependiente de ligadura múltiple (MLPA) para identificar grandes reordenamientos genómicos (LGR) en los genes BRCA1/2. Para determinar el impacto funcional de una variante intrónica recurrente (ATM c.5496?+?2_5496?+?5delTAAG), se realizó un ensayo de minigén.In Colombia and worldwide, breast cancer (BC) is the most frequently diagnosed neoplasia and the leading cause of death from cancer among women. Studies predominantly involve hereditary and familial cases, demonstrating a gap in the literature regarding the identification of germline mutations in unselected patients from Latin-America. Identification of pathogenic/likely pathogenic (P/LP) variants is important for shaping national genetic analysis policies, genetic counseling, and early detection strategies. The present study included 400 women with unselected breast cancer (BC), in whom we analyzed ten genes, using Whole Exome Sequencing (WES), know to confer risk for BC, with the aim of determining the genomic profile of previously unreported P/LP variants in the affected population. Additionally, Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) was performed to identify Large Genomic Rearrangements (LGRs) in the BRCA1/2 genes. To ascertain the functional impact of a recurrent intronic variant (ATM c.5496?+?2_5496?+?5delTAAG), a minigene assay was conducted.application/pdfhttps://doi.org/10.1186/s40246-024-00623-7https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/42905engHuman GenomicsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 InternationalAbierto (Texto Completo)http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Human Genomicsinstname:Universidad del Rosarioreponame:Repositorio Institucional EdocURUnselected breast cancerWhole exome sequencingPathogenic germline variantsMinigene assayUnselected breast cancerWhole exome sequencingPathogenic germline variantsMinigene assayGermline mutations of breast cancer susceptibility genes through expanded genetic analysis in unselected Colombian patientsarticleArtículo de Investigaciónhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85http://purl.org/coar/resource_type/c_6501Morel, AdrienSierra-Díaz, D.C.Fonseca-Mendoza, DoraContreras Bravo, NoraMolano González, NicolásBorras, M.Munevar ,I.Lema, M.Idrobo, H.Trujillo, D.Serrano, N.Orduz, AI.Lopera, D.González, J.Rojas, G.Londono-De Los Ríos, P.Manneh, R.Cabrera, RodrigoRubiano, W.de la Peña, J.Quintero, M.C.Mantilla, W.Restrepo, Carlos Martín.ORIGINALGermline mutations of breast cancer susceptibility genes.pdfapplication/pdf2070969https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/7869d962-e88d-4e59-8334-fe34b27b8a3c/download39f8ae1b0efe52f50846d450a4dd6548MD51TEXTGermline mutations of breast cancer susceptibility genes.pdf.txtGermline mutations of breast cancer susceptibility genes.pdf.txtExtracted texttext/plain66310https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/08e5ff45-c48b-4b7e-aced-7655adc8a7ec/downloade16f74a6340b9088ba8883d7377945cbMD52THUMBNAILGermline mutations of breast cancer susceptibility genes.pdf.jpgGermline mutations of breast cancer susceptibility genes.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4306https://repository.urosario.edu.co/bitstreams/ea28e622-f386-44d4-a551-8bebc24cb548/download790fe41c13b00865837081219e6bc9fdMD5310336/42905oai:repository.urosario.edu.co:10336/429052024-08-22 09:39:04.216http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalhttps://repository.urosario.edu.coRepositorio institucional EdocURedocur@urosario.edu.co