Recomendaciones para la detección y el diagnóstico por laboratorio de infecciones por arbovirus en la Región de las Américas
Los virus transmitidos por artrópodos (arbovirus) infectan a los seres humanos principalmente a través de la picadura de artrópodos hematófagos (por ejemplo, mosquitos, garrapatas y jejenes). Hay más de 100 arbovirus que causan infección y enfermedad en los seres humanos. Estas infecciones pueden se...
- Autores:
-
Usme Ciro, José Aldemar
- Tipo de recurso:
- Book
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Universidad Cooperativa de Colombia
- Repositorio:
- Repositorio UCC
- Idioma:
- OAI Identifier:
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- Acceso en línea:
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Diagnóstico
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Los virus transmitidos por artrópodos (arbovirus) infectan a los seres humanos principalmente a través de la picadura de artrópodos hematófagos (por ejemplo, mosquitos, garrapatas y jejenes). Hay más de 100 arbovirus que causan infección y enfermedad en los seres humanos. Estas infecciones pueden ser desde asintomáticas hasta poner en riesgo la vida (1). Los arbovirus constituyen un grupo polifilético de virus de varias familias y géneros (1), e incluyen Flavivirus (familia Flaviviridae), Alphavirus (familia Togaviridae), Orthobunyavirus (familia Peribunyaviridae), Phlebovirus (familia Phenuiviridae) y Coltivirus (familia Reoviridae). La mayoría tiene un genoma de ARN monocatenario (de sentido positivo para las familias Flaviviridae y Togaviridae y negativo para la familia Peribunyaviridae y Phenuiviridae), mientras que los de la familia Reoviridae tienen ácido ribonucleico (ARN) bicatenario (1). Los arbovirus más importantes en las Américas son los flavivirus, entre ellos, los virus del dengue (DENV, por su sigla en inglés), del Zika (ZIKV, por su sigla en inglés), de la fiebre amarilla (YFV, por su sigla en inglés), del Nilo occidental (WNV, por su sigla en inglés) y de la encefalitis de San Luis (SLEV, por su sigla en inglés). También son frecuentes los alfavirus, entre los que se encuentran los virus del chikunguña (CHIKV, por su sigla en inglés), Mayaro (MAYV, por su sigla en inglés) y los de las encefalitis equinas, y el virus Oropouche (OROV, por su sigla en inglés), del género Orthobunyavirus. Esta publicación se elaboró como parte de la Estrategia para la prevención y el control de las enfermedades arbovirales, adoptada por el 55.o Consejo Directivo de la Organización Panamericana de la Salud (OPS) en septiembre del 2016 (2). En particular, se refiere a la cuarta línea estratégica de acción, que destaca la importancia de reforzar la capacidad técnica de la Red de Laboratorios de Diagnóstico de Arbovirus en la Región de las Américas (RELDA) (2). El propósito de esta publicación es brindar recomendaciones técnicas a los laboratorios de salud pública de las Américas sobre las muestras y pruebas que se usan en los laboratorios de vigilancia de las arbovirosis y la interpretación de sus resultados. El documento también le será útil a los centros de investigación y laboratorios de universidades que tengan que identificar infecciones arbovirales como parte de su investigación, para contribuir a la caracterización de los arbovirus y al entendimiento de su dinámica de transmisión. |
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1. Control of Communicable Diseases Manual. 20.ª edición. Heymann DL, editor. Washington, DC: American Public Health Association; 2015. 3. Organización Panamericana de la Salud. Instrumento para el diagnóstico y la atención a pacientes con sospecha de arbovirosis. Washington, DC: OPS; 2017 [consultado el 15 de marzo del 2022]. Disponible en: http://iris.paho.org/ xmlui/handle/123456789/31448. 4. Organización Panamericana de la Salud. Guía para la vigilancia de la enfermedad por el virus del Zika y sus complicaciones. Edición 2018. Washington, DC: OPS; 2018 [consultado el 15 de marzo del 2022]. Disponible en: http://iris.paho.org/xmlui/handle/123456789/49518. 5. Organización Panamericana de la Salud, Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de Estados Unidos de América. Preparedness and response for chikungunya virus introduction in the Americas. Washington, DC: OPS; 2011 [consultado el 15 de marzo del 2022]. Disponible en: https://www.paho.org/hq/dmdocuments/2012/CHIKVEnglish. pdf. 6. Fernandez-Garcia MD, Mazzon M, Jacobs M, Amara A. Pathogenesis of flavivirus infections: using and abusing the host cell. Cell Host Microbe. 2009;5(4):318-28. 7. Jose J, Snyder JE, Kuhn RJ. A structural and functional perspective of alphavirus replication and assembly. Future Microbiol. 2009;4(7):837-56. 8. Leung JY, Ng MM, Chu JJ. Replication of alphaviruses: a review on the entry process of alphaviruses into cells. Adv Virol. 2011;2011:249640. 9. Travassos da Rosa JF, de Souza WM, Pinheiro FP, Figueiredo ML, Cardoso JF, Acrani GO, et al. Oropouche Virus: Clinical, Epidemiological, and Molecular Aspects of a Neglected Orthobunyavirus. Am J Trop Med Hyg. 2017;96(5):1019-30. 10. Sakkas H, Bozidis P, Franks A, Papadopoulou C. Oropouche Fever: A Review. Viruses. 2018;10(4). 11. Weaver SC, Charlier C, Vasilakis N, Lecuit M. Zika, chikungunya, and other emerging vector-borne viral diseases. Annu Rev Med. 2018;69:395-408. 12. Wang E, Ni H, Xu R, Barrett AD, Watowich SJ, Gubler DJ, et al. Evolutionary relationships of endemic/epidemic and sylvatic dengue viruses. J Virol. 2000;74(7):3227-34. 13. Braack L, Gouveia de Almeida AP, Cornel AJ, Swanepoel R, de Jager C. Mosquito-borne arboviruses of African origin: review of key viruses and vectors. Parasit Vectors. 2018;11(1):29. 14. Morse SS. Factors in the emergence of infectious diseases. Emerg Infect Dis. 1995;1(1):7-15. 15. Liang G, Gao X, Gould EA. Factors responsible for the emergence of arboviruses; strategies, challenges and limitations for their control. Emerg Microbes Infect. 2015;4(3):e18. 16. Coffey LL, Vasilakis N, Brault AC, Powers AM, Tripet F, Weaver SC. Arbovirus evolution in vivo is constrained by host alternation. Proc Natl Acad Sci USA. 2008;105(19):6970-5. 2. Organización Panamericana de la Salud. Estrategia para la prevención y control de las enfermedades arbovirales. 55.o Consejo Directivo, 68.a Sesión del Comité Regional de la OMS para las Américas; 26-30 de septiembre del 2016. Washington, DC: OPS; 2016 [consultado el 15 de marzo del 2022]. Disponible en: https://www.paho.org/hq/ dmdocuments/2016/CD55-16-s.pdf. 4. Organización Panamericana de la Salud. Guía para la vigilancia de la enfermedad por el virus del Zika y sus complicaciones. Edición 2018. Washington, DC: OPS; 2018 [consultado el 15 de marzo del 2022]. Disponible en: http://iris.paho.org/xmlui/handle/123456789/49518. 5. Organización Panamericana de la Salud, Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de Estados Unidos de América. Preparedness and response for chikungunya virus introduction in the Americas. Washington, DC: OPS; 2011 [consultado el 15 de marzo del 2022]. Disponible en: https://www.paho.org/hq/dmdocuments/2012/CHIKVEnglish. pdf. 6. Fernandez-Garcia MD, Mazzon M, Jacobs M, Amara A. Pathogenesis of flavivirus infections: using and abusing the host cell. Cell Host Microbe. 2009;5(4):318-28. 7. Jose J, Snyder JE, Kuhn RJ. A structural and functional perspective of alphavirus replication and assembly. Future Microbiol. 2009;4(7):837-56. 8. Leung JY, Ng MM, Chu JJ. Replication of alphaviruses: a review on the entry process of alphaviruses into cells. Adv Virol. 2011;2011:249640. 9. Travassos da Rosa JF, de Souza WM, Pinheiro FP, Figueiredo ML, Cardoso JF, Acrani GO, et al. Oropouche Virus: Clinical, Epidemiological, and Molecular Aspects of a Neglected Orthobunyavirus. Am J Trop Med Hyg. 2017;96(5):1019-30. 10. Sakkas H, Bozidis P, Franks A, Papadopoulou C. Oropouche Fever: A Review. Viruses. 2018;10(4). 11. Weaver SC, Charlier C, Vasilakis N, Lecuit M. Zika, chikungunya, and other emerging vector-borne viral diseases. Annu Rev Med. 2018;69:395-408. 12. Wang E, Ni H, Xu R, Barrett AD, Watowich SJ, Gubler DJ, et al. Evolutionary relationships of endemic/epidemic and sylvatic dengue viruses. J Virol. 2000;74(7):3227-34. 13. Braack L, Gouveia de Almeida AP, Cornel AJ, Swanepoel R, de Jager C. Mosquito-borne arboviruses of African origin: review of key viruses and vectors. Parasit Vectors. 2018;11(1):29. 14. Morse SS. Factors in the emergence of infectious diseases. Emerg Infect Dis. 1995;1(1):7-15. 15. Liang G, Gao X, Gould EA. Factors responsible for the emergence of arboviruses; strategies, challenges and limitations for their control. Emerg Microbes Infect. 2015;4(3):e18. 16. Coffey LL, Vasilakis N, Brault AC, Powers AM, Tripet F, Weaver SC. Arbovirus evolution in vivo is constrained by host alternation. Proc Natl Acad Sci USA. 2008;105(19):6970-5. |
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Los arbovirus constituyen un grupo polifilético de virus de varias familias y géneros (1), e incluyen Flavivirus (familia Flaviviridae), Alphavirus (familia Togaviridae), Orthobunyavirus (familia Peribunyaviridae), Phlebovirus (familia Phenuiviridae) y Coltivirus (familia Reoviridae). La mayoría tiene un genoma de ARN monocatenario (de sentido positivo para las familias Flaviviridae y Togaviridae y negativo para la familia Peribunyaviridae y Phenuiviridae), mientras que los de la familia Reoviridae tienen ácido ribonucleico (ARN) bicatenario (1). Los arbovirus más importantes en las Américas son los flavivirus, entre ellos, los virus del dengue (DENV, por su sigla en inglés), del Zika (ZIKV, por su sigla en inglés), de la fiebre amarilla (YFV, por su sigla en inglés), del Nilo occidental (WNV, por su sigla en inglés) y de la encefalitis de San Luis (SLEV, por su sigla en inglés). También son frecuentes los alfavirus, entre los que se encuentran los virus del chikunguña (CHIKV, por su sigla en inglés), Mayaro (MAYV, por su sigla en inglés) y los de las encefalitis equinas, y el virus Oropouche (OROV, por su sigla en inglés), del género Orthobunyavirus. Esta publicación se elaboró como parte de la Estrategia para la prevención y el control de las enfermedades arbovirales, adoptada por el 55.o Consejo Directivo de la Organización Panamericana de la Salud (OPS) en septiembre del 2016 (2). En particular, se refiere a la cuarta línea estratégica de acción, que destaca la importancia de reforzar la capacidad técnica de la Red de Laboratorios de Diagnóstico de Arbovirus en la Región de las Américas (RELDA) (2). El propósito de esta publicación es brindar recomendaciones técnicas a los laboratorios de salud pública de las Américas sobre las muestras y pruebas que se usan en los laboratorios de vigilancia de las arbovirosis y la interpretación de sus resultados. El documento también le será útil a los centros de investigación y laboratorios de universidades que tengan que identificar infecciones arbovirales como parte de su investigación, para contribuir a la caracterización de los arbovirus y al entendimiento de su dinámica de transmisión.Agradecimientos. -- Siglas. -- Introducción. -- 1 Emergencia y ciclo de vida de los arbovirus. -- 1.1 Estructura, genoma y ciclo de vida de los arbovirus. -- 1.2 Origen y dinámica evolutiva de los arbovirus. -- 2 Toma, conservación y transporte de muestras. -- 2.1 Muestras para el diagnóstico de infecciones arbovirales . -- 2.2 Información epidemiológica y clínica adjunta a las muestras. -- 2.3 Envío de muestras al laboratorio. -- 2.4 Recepción y manipulación de las muestras en el laboratorio. -- 2.5 Envío de muestras a los laboratorios de referencia. -- 3 Bioseguridad y flujo de trabajo en el laboratorio. -- 3.1 Consideraciones sobre bioseguridad. -- 3.2 Flujo de trabajo en el laboratorio. -- 4 Diagnóstico por laboratorio del dengue, el chikunguña, el Zika y la fiebre amarilla. -- 4.1 Diagnóstico virológico: métodos directos. -- 4.2 Diagnóstico serológico: métodos indirectos. -- 4.3 Algoritmos recomendados para el diagnóstico por laboratorio de infecciones por los virus del dengue, el chikunguña, el Zika y la fiebre amarilla. -- 5 Diagnóstico por laboratorio de infecciones por los virus Mayaro y Oropouche. -- 5.1 Infección por el virus Mayaro . -- 5.2 Infección por el virus Oropouche. -- 6. Diagnóstico por laboratorio de otras infecciones arbovirales neurotrópicas. -- 6.1 Métodos virológicos. -- 6.2 Métodos serológicos. -- 7. Caracterización de genotipos y linajes por secuenciación nucleotídica. -- Referencias.https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=00003185070000-0002-8093-0544https://scienti.minciencias.gov.co/gruplac/jsp/visualiza/visualizagr.jsp?nro=00000000008981jose.usmec@ucc.edu.cohttps://scholar.google.com.co/citations?user=cU2KyT4AAAAJ&hl=en64Universidad Cooperativa de Colombia, Facultad de Ciencias de la Salud, Medicina, Santa MartaOrganización Panamericana de la SaludMedicinaSanta Martahttps://iris.paho.org/handle/10665.2/56321?show=full1. Control of Communicable Diseases Manual. 20.ª edición. Heymann DL, editor. Washington, DC: American Public Health Association; 2015.3. Organización Panamericana de la Salud. Instrumento para el diagnóstico y la atención a pacientes con sospecha de arbovirosis. Washington, DC: OPS; 2017 [consultado el 15 de marzo del 2022]. Disponible en: http://iris.paho.org/ xmlui/handle/123456789/31448. 4. Organización Panamericana de la Salud. Guía para la vigilancia de la enfermedad por el virus del Zika y sus complicaciones. Edición 2018. Washington, DC: OPS; 2018 [consultado el 15 de marzo del 2022]. Disponible en: http://iris.paho.org/xmlui/handle/123456789/49518. 5. Organización Panamericana de la Salud, Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de Estados Unidos de América. Preparedness and response for chikungunya virus introduction in the Americas. Washington, DC: OPS; 2011 [consultado el 15 de marzo del 2022]. Disponible en: https://www.paho.org/hq/dmdocuments/2012/CHIKVEnglish. pdf. 6. Fernandez-Garcia MD, Mazzon M, Jacobs M, Amara A. Pathogenesis of flavivirus infections: using and abusing the host cell. Cell Host Microbe. 2009;5(4):318-28. 7. Jose J, Snyder JE, Kuhn RJ. 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