Molecular detection of Leptospira in synanthropic and wild rodents from Villavicencio municipality, Colombia
Introducción: Los roedores son potenciales transmisores de Leptospira spp. En el municipio de Villavicencio, Colombia, la leptospirosis es una enfermedad que, aunque debe notificarse obligatoriamente, sigue subreportada. En esta región, algunas especies de roedores pueden ser reservorios de leptospi...
- Autores:
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Sánchez Lerma, Liliana
Rojas Gulloso, Andres Camilo
Mattar, Salim
Cogollo, Veronica
- Tipo de recurso:
- Article of investigation
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Universidad Cooperativa de Colombia
- Repositorio:
- Repositorio UCC
- Idioma:
- OAI Identifier:
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- Acceso en línea:
- https://hdl.handle.net/20.500.12494/46842
- Palabra clave:
- roedores; reservorios; leptospiras patógenas; Villavicencio.
rodents, reservoirs, pathogenic Leptospira, Villavicencio.
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Introducción: Los roedores son potenciales transmisores de Leptospira spp. En el municipio de Villavicencio, Colombia, la leptospirosis es una enfermedad que, aunque debe notificarse obligatoriamente, sigue subreportada. En esta región, algunas especies de roedores pueden ser reservorios de leptospiras patógenas, situación que se desconoce. Objetivo: Detectar la presencia de Leptospira spp. a través del análisis molecular en roedores (Rodentia) de áreas periurbanas y rurales del municipio de Villavicencio, Colombia. Métodos: Para el trampeo se seleccionaron áreas periurbanas y rurales de las veredas pertenecientes al municipio de Villavicencio. Las áreas escogidas presentaban condiciones ecológicas similares: cerca de cuerpos de agua y áreas peridomiciliarias; algunas de ellas localizadas en campos de cultivos de la agricultura. Se extirparon los riñones de los roedores y se conservaron en nitrógeno líquido. Se extrajo el ADN usando un estuche comercial y posteriormente se amplificó mediante reacción en cadena de la polimerasa convencional. Resultados: Las especies de roedores colectadas fueron: Rattus rattus, Mus musculus, Zygodontomys brevicauda, Oligoryzomys sp., Hylaeamys (ahora Oryzomys) y Proechimys oconnelli. El ADN de leptospira se amplificó en seis roedores y los amplicones purificados se enviaron a Macrogen Inc. (Seoul, Korea) para secuenciación. El análisis de alineamiento de los productos secuenciados demostró un 98,64 % de cobertura e identidad con Leptospira interrogans. Conclusiones: Este es el primer estudio llevado a cabo en roedores silvestres y sinantrópicos en el municipio de Villavicencio. |
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1. Castellar A, Arrieta P, Caraballo L, Torres M, Ríos L. Detección de Leptospira spp. patógenas en tejido renal de ratón casero (Mus musculus) en Sincelejo, Colombia. Revista Biosalud. 2016;15(1):41-9. DOI: https://doi.org/10.17151/biosa.2016.15.1.5 2. Boey K, Shiokawa K, Sreekumari Rajeev S. Leptospira infection in rats: A literature review of global prevalence and distribution. PLOS NTD. 2019;13(8):e0007499. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0007499 3. Sánchez L. Dengue, leptospirosis, hantavirosis y rickettsiosis en pacientes con síndrome febril agudo no palúdico en el Meta, Colombia (2013-2014). Instituto de Medicina Tropical Pedro Kouri; 2017. 4. Syakbanah N, Fuad A. Human leptospirosis outbreak: A year after the ‘Cempaka’ tropical cyclone. JKL. 2021;13(4): 211-8. 5. Pellizzaro M, Martins C, Yamakawa A, Da Cunha D, Morikawa V, Ferreira F, et al. Molecular detection of Leptospira spp. in rats as early spatial predictor for human disease in an endemic urban area. PLoS ONE. 2019;14(5):e0216830. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0216830 6. Valbuena C, Pefaur J. Determinación de leptospirosis en roedores y marsupiales de la región sur del lago de Maracaibo, Estado Mérida, Venezuela. Revista Científica. 2015;25(3):193-9. 7. Pérez J, Agudelo P, Parra G, Ochoa J, Arboleda M. Incidencia y subregistro de casos de leptospirosis diagnosticados con tres métodos diferentes en Urabá, Colombia. Biomédica. 2019;39(supl 1):150-62. DOI: https://doi.org/10.7705/biomedica.v39i0.4577 8. Calderón A, Rodríguez V, Guzmán C. Anticuerpos de Leptospira interrogans (sensu lato) en trabajadores de granjas porcinas del medio Sinú, Córdoba (Colombia) ¿enfermedad profesional? Rev Colombiana Cienc Anim. 2016;8(1):56-64. 9. Ortiz D, Navarrete J, Pinto C. Prevalencia de leptospirosis en humanos en el Distrito Capital. Revista de Investigaciones en Seguridad Social y Salud. 2009;11:51-8. 10. Romero M, Sánchez J, Hayek L. Prevalencia de anticuerpos contra Leptospira en población urbana humana y canina del Departamento del Tolima. Rev. Salud Pública. 2010;12(2):268-75. 11. DANE. Censo nacional de poblaciones y vivienda 2018-Colombia (Villavicencio). Colombia; 2018. Disponible en: https://sitios.dane.gov.co/cnpv/#!/ 12. Sánchez L, García C, Mattar S, Rodríguez I. Seroprevalencia de leptospirosis en pacientes con síndrome febril no palúdico. Rev Cubana Med Trop. 2018;70(1):45-54. |
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Objetivo: Detectar la presencia de Leptospira spp. a través del análisis molecular en roedores (Rodentia) de áreas periurbanas y rurales del municipio de Villavicencio, Colombia. Métodos: Para el trampeo se seleccionaron áreas periurbanas y rurales de las veredas pertenecientes al municipio de Villavicencio. Las áreas escogidas presentaban condiciones ecológicas similares: cerca de cuerpos de agua y áreas peridomiciliarias; algunas de ellas localizadas en campos de cultivos de la agricultura. Se extirparon los riñones de los roedores y se conservaron en nitrógeno líquido. Se extrajo el ADN usando un estuche comercial y posteriormente se amplificó mediante reacción en cadena de la polimerasa convencional. Resultados: Las especies de roedores colectadas fueron: Rattus rattus, Mus musculus, Zygodontomys brevicauda, Oligoryzomys sp., Hylaeamys (ahora Oryzomys) y Proechimys oconnelli. El ADN de leptospira se amplificó en seis roedores y los amplicones purificados se enviaron a Macrogen Inc. (Seoul, Korea) para secuenciación. El análisis de alineamiento de los productos secuenciados demostró un 98,64 % de cobertura e identidad con Leptospira interrogans. Conclusiones: Este es el primer estudio llevado a cabo en roedores silvestres y sinantrópicos en el municipio de Villavicencio.Introduction: Rodents are potential transmitters of Leptospira spp. In the municipality of Villavicencio, Colombia, leptospirosis is a disease that, although notifiable, is still underreported. In this region, rodent species that can host pathogenic leptospira remain unknown. Objective: To detect the presence of Leptospira spp. through molecular analysis in rodents (Rodentia) from peri-urban and rural areas belonging to the municipality of Villavicencio in Colombia. Methods: Peri-urban and rural areas of the townships belonging to Villavicencio municipality were selected for sampling. These areas presented similar ecological conditions: they were near water bodies and peridomiciliary areas, and some of them included fields of agricultural crops. Rodents´ kidneys were removed and frozen in liquid nitrogen. DNA was extracted using a commercial kit and subsequently amplified through conventional polymerase chain reaction.Results: The rodent species collected were: Rattus rattus, Mus musculus, Zygodontomys brevicauda, Oligoryzomys sp, Hylaeamys (formerly Oryzomys) and Proechimys cf. oconnelli. Leptospira DNA was amplified in six rodents and the purified amplicons were sent to Macrogen Inc. (Seoul, Korea) for sequencing. The alignment analysis of the sequenced products demonstrated 98.64% of coverage and identity with Leptospira interrogans. Conclusions: This is the first study carried out on wild and synanthropic rodents in the municipality of Villavicencio. The incidence of leptospirosis raises the alarm due to the important role of these small mammals in the transmission of this zoonosis, which is considered the second cause, after dengue, of undifferentiated febrile illness in Villavicencio.https://orcid.org/0000-0001-7024-3874GRVIliliana.sanchez@campusucc.edu.co8Universidad Cooperativa de ColombiaMedicinaVillavicencioroedores; reservorios; leptospiras patógenas; Villavicencio.rodents, reservoirs, pathogenic Leptospira, Villavicencio.Molecular detection of Leptospira in synanthropic and wild rodents from Villavicencio municipality, ColombiaArtículos Científicoshttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionAtribucióninfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Revista Cubana de Medicina Tropical1. Castellar A, Arrieta P, Caraballo L, Torres M, Ríos L. Detección de Leptospira spp. patógenas en tejido renal de ratón casero (Mus musculus) en Sincelejo, Colombia. Revista Biosalud. 2016;15(1):41-9. DOI: https://doi.org/10.17151/biosa.2016.15.1.5 2. Boey K, Shiokawa K, Sreekumari Rajeev S. Leptospira infection in rats: A literature review of global prevalence and distribution. PLOS NTD. 2019;13(8):e0007499. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0007499 3. Sánchez L. Dengue, leptospirosis, hantavirosis y rickettsiosis en pacientes con síndrome febril agudo no palúdico en el Meta, Colombia (2013-2014). Instituto de Medicina Tropical Pedro Kouri; 2017. 4. Syakbanah N, Fuad A. Human leptospirosis outbreak: A year after the ‘Cempaka’ tropical cyclone. JKL. 2021;13(4): 211-8. 5. Pellizzaro M, Martins C, Yamakawa A, Da Cunha D, Morikawa V, Ferreira F, et al. Molecular detection of Leptospira spp. in rats as early spatial predictor for human disease in an endemic urban area. PLoS ONE. 2019;14(5):e0216830. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0216830 6. Valbuena C, Pefaur J. Determinación de leptospirosis en roedores y marsupiales de la región sur del lago de Maracaibo, Estado Mérida, Venezuela. Revista Científica. 2015;25(3):193-9. 7. Pérez J, Agudelo P, Parra G, Ochoa J, Arboleda M. Incidencia y subregistro de casos de leptospirosis diagnosticados con tres métodos diferentes en Urabá, Colombia. Biomédica. 2019;39(supl 1):150-62. DOI: https://doi.org/10.7705/biomedica.v39i0.4577 8. Calderón A, Rodríguez V, Guzmán C. Anticuerpos de Leptospira interrogans (sensu lato) en trabajadores de granjas porcinas del medio Sinú, Córdoba (Colombia) ¿enfermedad profesional? Rev Colombiana Cienc Anim. 2016;8(1):56-64. 9. Ortiz D, Navarrete J, Pinto C. Prevalencia de leptospirosis en humanos en el Distrito Capital. Revista de Investigaciones en Seguridad Social y Salud. 2009;11:51-8. 10. Romero M, Sánchez J, Hayek L. Prevalencia de anticuerpos contra Leptospira en población urbana humana y canina del Departamento del Tolima. Rev. Salud Pública. 2010;12(2):268-75. 11. DANE. Censo nacional de poblaciones y vivienda 2018-Colombia (Villavicencio). Colombia; 2018. Disponible en: https://sitios.dane.gov.co/cnpv/#!/ 12. Sánchez L, García C, Mattar S, Rodríguez I. Seroprevalencia de leptospirosis en pacientes con síndrome febril no palúdico. 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