Metodología para el ensamblaje de los reads obtenidos por secuenciación de nueva generación (NGS) en la plataforma Ilumina HiSeq 2500 del genoma completo del pasto Kikuyo (Pennisetum clandestinum Hochst. Ex. Chiov)

El objetivo de este estudio fue describir una metodología para ensamblaje de los reads de esos genes (Nrt1.1, Nrt2.1, Nrt1.2 y Amt1) a partir del secuenciamiento total del genoma del pasto Kikuyo. A partir de muestras de la planta Kikuyo se realizó la extracción de ADN con una relación 260/280 de 2,...

Full description

Autores:
Gamarra Rueda, Ramón
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2016
Institución:
Universidad CES
Repositorio:
Repositorio Digital - Universidad CES
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.ces.edu.co:10946/1843
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10946/1843
Palabra clave:
Medicina veterinaria y zootecnia
Forraje
Nitrógeno
Plantas
Secuenciación
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description El objetivo de este estudio fue describir una metodología para ensamblaje de los reads de esos genes (Nrt1.1, Nrt2.1, Nrt1.2 y Amt1) a partir del secuenciamiento total del genoma del pasto Kikuyo. A partir de muestras de la planta Kikuyo se realizó la extracción de ADN con una relación 260/280 de 2,17 y alta calidad del material extraído. GenomaCES realizó el secuenciamiento de nueva generación usando la plataforma Ilumina Hiseq 2500 y se diseñaron dos librerías con tamaños de 230 pb y 450 pb.
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