Caracterización molecular de la colección colombiana de lulo (Solanum quitoense) Lam

En los Banco de germoplasma del Estado, manejados por Corpoica, se conserva una colección de lulo y especies relacionadas de la sección Lasiocarpa. Esta Colección esta siendo caracterizada con base en caracteres morfo-agronómicos. Se consideró importante realizar una evaluación complementaria con ma...

Full description

Autores:
Fory, Paola
Sánchez Torres, Ines
Bohórquez, Adriana
Medina Cano, Clara Inés
Lobo Arias, Mario
Tipo de recurso:
Conferencia (Ponencia)
Fecha de publicación:
2004
Institución:
Agrosavia
Repositorio:
Agrosavia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.agrosavia.co:20.500.12324/21266
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/20.500.12324/21266
Palabra clave:
Genética vegetal y fitomejoramiento - F30
Solanum quitoense
Biotecnología
Genómica
Fitomejoramiento
Frutales
Rights
License
Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International
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description En los Banco de germoplasma del Estado, manejados por Corpoica, se conserva una colección de lulo y especies relacionadas de la sección Lasiocarpa. Esta Colección esta siendo caracterizada con base en caracteres morfo-agronómicos. Se consideró importante realizar una evaluación complementaria con marcadores moleculares (AFLP: Amplified Fragment Length Polymorphism). El análisis molecular se realizó en los laboratorios de la Unidad de Biotecnología del Centro Internacional de Agricultura (CIAT), Se evaluaron 159 accesiones utilizando el "kit AFLP®" Análisis System I (INVITROG ENTm) con modificaciones para ADN genómico de plantas. Los productos amplificados se corrieron en geles de poliacrilamida at 6% y los polimorfismos se visualizaron mediante la técnica de tinción con Nitrato de Plata. La matriz de similaridad se construya con el programa NTSYS versión 2.02 utilizando el subprograma "Simqual" (Similarity for qualitative data) y el coeficiente de Dice, L. Fl. Los coeficientes de similaridad fueron a su vez introducidos en el subprograma "SAHN" (Sequential Aglomerative Hierarchical Nested Cluster Analysis) para construir dendrogramas usando el método de unión media aritmética no ponderada "UPGMA" (Unweighted Pair-Group Method, Arithmetic Avera-ge). Adicionalmente, se realizo un Análisis de Correspondencia Múltiple (ACM), con el procedimiento CORRESP del programa estadístico SAS. Este análisis visualiza la dispersión de los individuos en un espacio multidimensional, relacionando cada una de las diferentes variables (bandas) con los individuos en un mismo gráfico, originando tantas dimensiones como variables se tengan. Para este estudio, tres dimensiones fueron suficientes para explicar Ia mayor parte de la variación entre las accesiones estudiadas. De las 30 combinaciones de oligonucleotidos evaluadas, las mas polimórficas fueron la combinación E-ACG/M-CAT y la combinación E-ACG/M-CTC, con un total de 206 y 1 70 bandas polimórficas, respectivamente. En general, el análisis de similaridad mostró un dendograma determinado por 13 agrupamientos y los resultados de este estudio, corroboraron la capacidad de los AFLP's en revelar el polimorfismo de las especies estudiadas. La mayoría de las bandas observadas mostraron un alto polimorfismo en las especies silvestres comparada con la especie cultiva-da. S. quitoense se agrupó con los clones "La Selva" y los híbridos de Heiser, mostrando un indice de similaridad que osciló entre 0.67 a 0.99. Los resultados del dendrograma separaron las especies andinas (S. quitoense, S. hirtum, S. pseudolulo, S. vesstissimun y S. pectinatum) de las especies Amazónicas (S. stramonifoliun y S. sessiliflorum) de la sección Lasiocarpa y al interior de cada especie no hubo una separación Clara por origen geográfico, ni tampoco en S. quitoense, se evidenció la separación por variedades. Los resultados obtenidos de este estudio contribuyen al conocimiento de Ia composición genética de los materiales evaluados y a fortalecer los procesos de caracterización y evaluación de la colección de lulo en Colombia con fines de conservación y mejoramiento genético.
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El análisis molecular se realizó en los laboratorios de la Unidad de Biotecnología del Centro Internacional de Agricultura (CIAT), Se evaluaron 159 accesiones utilizando el "kit AFLP®" Análisis System I (INVITROG ENTm) con modificaciones para ADN genómico de plantas. Los productos amplificados se corrieron en geles de poliacrilamida at 6% y los polimorfismos se visualizaron mediante la técnica de tinción con Nitrato de Plata. La matriz de similaridad se construya con el programa NTSYS versión 2.02 utilizando el subprograma "Simqual" (Similarity for qualitative data) y el coeficiente de Dice, L. Fl. Los coeficientes de similaridad fueron a su vez introducidos en el subprograma "SAHN" (Sequential Aglomerative Hierarchical Nested Cluster Analysis) para construir dendrogramas usando el método de unión media aritmética no ponderada "UPGMA" (Unweighted Pair-Group Method, Arithmetic Avera-ge). Adicionalmente, se realizo un Análisis de Correspondencia Múltiple (ACM), con el procedimiento CORRESP del programa estadístico SAS. Este análisis visualiza la dispersión de los individuos en un espacio multidimensional, relacionando cada una de las diferentes variables (bandas) con los individuos en un mismo gráfico, originando tantas dimensiones como variables se tengan. Para este estudio, tres dimensiones fueron suficientes para explicar Ia mayor parte de la variación entre las accesiones estudiadas. De las 30 combinaciones de oligonucleotidos evaluadas, las mas polimórficas fueron la combinación E-ACG/M-CAT y la combinación E-ACG/M-CTC, con un total de 206 y 1 70 bandas polimórficas, respectivamente. En general, el análisis de similaridad mostró un dendograma determinado por 13 agrupamientos y los resultados de este estudio, corroboraron la capacidad de los AFLP's en revelar el polimorfismo de las especies estudiadas. La mayoría de las bandas observadas mostraron un alto polimorfismo en las especies silvestres comparada con la especie cultiva-da. S. quitoense se agrupó con los clones "La Selva" y los híbridos de Heiser, mostrando un indice de similaridad que osciló entre 0.67 a 0.99. Los resultados del dendrograma separaron las especies andinas (S. quitoense, S. hirtum, S. pseudolulo, S. vesstissimun y S. pectinatum) de las especies Amazónicas (S. stramonifoliun y S. sessiliflorum) de la sección Lasiocarpa y al interior de cada especie no hubo una separación Clara por origen geográfico, ni tampoco en S. quitoense, se evidenció la separación por variedades. Los resultados obtenidos de este estudio contribuyen al conocimiento de Ia composición genética de los materiales evaluados y a fortalecer los procesos de caracterización y evaluación de la colección de lulo en Colombia con fines de conservación y mejoramiento genético.Lulo-Solanum quitoense - Solanum hyporhodiumapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia - UNALCentro de Desarrollo Tecnológico de Frutales - CDTFCorporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - CORPOICAUniversidad del Quindío - UNIQUINDIOFondo de Fomento Hortifrutícola - FNFHAttribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Acceso a texto completohttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Caracterización molecular de la colección colombiana de lulo (Solanum quitoense) LamGenética vegetal y fitomejoramiento - F30Solanum quitoenseBiotecnologíaGenómicaFitomejoramientoFrutalesMemorias del V seminario nacional e internacional de frutales: Tecnología para la Transformación de Frutas.Manizales (Colombia)443TécnicoProfesionalTécnicopaperPonenciahttp://purl.org/coar/resource_type/c_8544info:eu-repo/semantics/lecturehttps://purl.org/redcol/resource_type/ARTOTRhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85ColombiaORIGINAL41331_27422.pdfapplication/pdf81550https://repository.agrosavia.co/bitstream/20.500.12324/21266/1/41331_27422.pdf75639d4be4337f1b01259369fb520217MD51open accessTHUMBNAIL41331_27422.pdf.jpg41331_27422.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg8710https://repository.agrosavia.co/bitstream/20.500.12324/21266/2/41331_27422.pdf.jpg1750f093b46cfebba3cf2de38c5c745eMD52open access20.500.12324/21266oai:repository.agrosavia.co:20.500.12324/212662022-11-28 09:58:21.834open accessAgrosavia - Corporación colombiana de investigación agropecuariabac@agrosavia.co