Marcadores microsatélites identificados para la discriminación varietal de clones de Hevea brasiliensis
Hevea brasiliensis una planta de la familia Euphorbiaceae originaria de la región amazónica es cultivada comercialmente para la producción de caucho natural por más de 40 países. De estos, en América solo se cultiva alrededor de 2% del área total (HOU, F. & WU, 2017). En Colombia, el cultivo de...
- Autores:
-
Ruíz Avila, camilo Andres
Gómez Vargas, Yolanda
Burgos Paz, William Orlando
Martínez Sarmiento, Rodrigo
Tapiero, Anibal L.
- Tipo de recurso:
- http://purl.org/coar/resource_type/c_6670
- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Agrosavia
- Repositorio:
- Agrosavia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.agrosavia.co:20.500.12324/35522
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/20.500.12324/35522
- Palabra clave:
- Economía y políticas de desarrollo - E14
Hevea brasiliensis
Caucho
Desarrollo económico y social
Clones
Permanentes
- Rights
- License
- Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International
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Hevea brasiliensis una planta de la familia Euphorbiaceae originaria de la región amazónica es cultivada comercialmente para la producción de caucho natural por más de 40 países. De estos, en América solo se cultiva alrededor de 2% del área total (HOU, F. & WU, 2017). En Colombia, el cultivo de caucho ha cobrado gran importancia recientemente, como una actividad que promueve el desarrollo económico y social basado en la agroindustria con alrededor de 68.000 ha distribuidas por todo el territorio nacional (CENICAUCHO- CORPOICA, 2013; MINISTERIO de AGRICULTURA, 2016). El auge del área coincide con la disponibilidad de limitadas tecnologías que garanticen la identidad de los materiales de caucho comercializados. Por tal razón, para efectos de apoyar la resolución No. 001478/2006 ICA, que exige la certificación de la identidad de los clones de Hevea brasiliensis que comercializan mediante análisis genéticos, ante la necesidad de que el productor adquiera plantas homologadas acorde con sus requerimientos asociados a la vocación de sus fincas, en correspondencia con las zonificaciones por área óptima. Utilizando marcadores moleculares STR (del inglés “Short Tandem Repeat”) que permiten identificar clones de caucho independientemente del estado fenológico y las variaciones derivadas de las condiciones ambientales, se evaluaron 9 marcadores moleculares microsatélites (SSR) amplificados mediante primers fluoromarcados y visualizados por electroforesis capilar a partir del ADN extraído de tejido foliar de clones comerciales de H. brasiliensis. Marcadores escogidos por su nivel de polimorfismo, codominancia, repetibilidad y alta automatización. El propósito fue seleccionar los marcadores más polimórficos y generar patrones electroforéticos de cada clon, a efectos de disponer de tecnologías más apropiadas para realizar una identificación más precisa de los materiales a homologar. |
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En Colombia, el cultivo de caucho ha cobrado gran importancia recientemente, como una actividad que promueve el desarrollo económico y social basado en la agroindustria con alrededor de 68.000 ha distribuidas por todo el territorio nacional (CENICAUCHO- CORPOICA, 2013; MINISTERIO de AGRICULTURA, 2016). El auge del área coincide con la disponibilidad de limitadas tecnologías que garanticen la identidad de los materiales de caucho comercializados. Por tal razón, para efectos de apoyar la resolución No. 001478/2006 ICA, que exige la certificación de la identidad de los clones de Hevea brasiliensis que comercializan mediante análisis genéticos, ante la necesidad de que el productor adquiera plantas homologadas acorde con sus requerimientos asociados a la vocación de sus fincas, en correspondencia con las zonificaciones por área óptima. Utilizando marcadores moleculares STR (del inglés “Short Tandem Repeat”) que permiten identificar clones de caucho independientemente del estado fenológico y las variaciones derivadas de las condiciones ambientales, se evaluaron 9 marcadores moleculares microsatélites (SSR) amplificados mediante primers fluoromarcados y visualizados por electroforesis capilar a partir del ADN extraído de tejido foliar de clones comerciales de H. brasiliensis. Marcadores escogidos por su nivel de polimorfismo, codominancia, repetibilidad y alta automatización. El propósito fue seleccionar los marcadores más polimórficos y generar patrones electroforéticos de cada clon, a efectos de disponer de tecnologías más apropiadas para realizar una identificación más precisa de los materiales a homologar.Caucho natural-Ficus elasticaapplication/pdfspaCorporación colombiana de investigación agropecuaria - AGROSAVIAAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Marcadores microsatélites identificados para la discriminación varietal de clones de Hevea brasiliensisEconomía y políticas de desarrollo - E14Hevea brasiliensisCauchoDesarrollo económico y socialClonesPermanentesInvestigadorProfesionalCientíficoC.I TibaitatáColombiaconference posterPósterhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6670info:eu-repo/semantics/otherhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85ORIGINALmarcadores microsatelitales.pdfmarcadores microsatelitales.pdfapplication/pdf1616153https://repository.agrosavia.co/bitstream/20.500.12324/35522/6/marcadores%20microsatelitales.pdfd8ffb760a69bdd313dd58159942d57e2MD56open accessCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8805https://repository.agrosavia.co/bitstream/20.500.12324/35522/2/license_rdf4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347MD52open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repository.agrosavia.co/bitstream/20.500.12324/35522/3/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD53open accessTHUMBNAILmarcadores microsatelitales.pdf.jpgmarcadores microsatelitales.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg15201https://repository.agrosavia.co/bitstream/20.500.12324/35522/5/marcadores%20microsatelitales.pdf.jpg396e439ac3074107d40a294aeec67e98MD55open access20.500.12324/35522oai:repository.agrosavia.co:20.500.12324/355222024-06-12 14:38:57.567open accessAgrosavia - Corporación colombiana de investigación agropecuariabac@agrosavia.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 |